Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrioQ0KL02 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrioQ0KL02 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms