Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ssrp1Q08943 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ssrp1Q08943 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms