Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MitfQ08874 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MitfQ08874 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MitfQ08874 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MitfQ08874 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MitfQ08874 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MitfQ08874 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MitfQ08874 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MitfQ08874 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MitfQ08874 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MitfQ08874 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms