Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD47Q08722 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD47Q08722 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD47Q08722 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD47Q08722 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD47Q08722 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD47Q08722 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD47Q08722 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD47Q08722 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD47Q08722 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD47Q08722 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD47Q08722 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD47Q08722 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD47Q08722 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD47Q08722 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD47Q08722 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD47Q08722 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD47Q08722 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD47Q08722 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD47Q08722 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD47Q08722 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD47Q08722 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD47Q08722 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD47Q08722 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD47Q08722 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD47Q08722 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD47Q08722 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD47Q08722 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD47Q08722 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CD47Q08722 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD47Q08722 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD47Q08722 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD47Q08722 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD47Q08722 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD47Q08722 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD47Q08722 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD47Q08722 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD47Q08722 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD47Q08722 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD47Q08722 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD47Q08722 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD47Q08722 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD47Q08722 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD47Q08722 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD47Q08722 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD47Q08722 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD47Q08722 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD47Q08722 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD47Q08722 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD47Q08722 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD47Q08722 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD47Q08722 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CD47Q08722 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CD47Q08722 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD47Q08722 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD47Q08722 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD47Q08722 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD47Q08722 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CD47Q08722 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD47Q08722 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD47Q08722 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD47Q08722 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD47Q08722 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD47Q08722 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD47Q08722 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD47Q08722 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD47Q08722 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD47Q08722 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD47Q08722 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD47Q08722 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD47Q08722 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD47Q08722 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CD47Q08722 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD47Q08722 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD47Q08722 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD47Q08722 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD47Q08722 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD47Q08722 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD47Q08722 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD47Q08722 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD47Q08722 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD47Q08722 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD47Q08722 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD47Q08722 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms