Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDH1Q08174 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDH1Q08174 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDH1Q08174 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms