Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CbfbQ08024 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CbfbQ08024 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CbfbQ08024 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CbfbQ08024 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CbfbQ08024 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CbfbQ08024 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CbfbQ08024 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CbfbQ08024 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CbfbQ08024 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CbfbQ08024 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CbfbQ08024 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CbfbQ08024 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CbfbQ08024 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CbfbQ08024 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CbfbQ08024 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CbfbQ08024 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms