Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PPARAQ07869 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPARAQ07869 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PPARAQ07869 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPARAQ07869 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms