Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK18Q07002 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK18Q07002 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.4 ms