Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PSME1Q06323 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
PSME1Q06323 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PSME1Q06323 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms