Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Caprin2Q05A80 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Caprin2Q05A80 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms