Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A2Q05940 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC18A2Q05940 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms