Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRKCQQ04759 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKCQQ04759 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms