Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
ERCC6Q03468 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
ERCC6Q03468 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC42■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
ERCC6Q03468 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC41.91■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ERCC6Q03468 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC41.88■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC41.88■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC41.86■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
ERCC6Q03468 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms