Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Epha4Q03137 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Epha4Q03137 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Epha4Q03137 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Epha4Q03137 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Epha4Q03137 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Epha4Q03137 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Epha4Q03137 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Epha4Q03137 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Epha4Q03137 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Epha4Q03137 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Epha4Q03137 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Epha4Q03137 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epha4Q03137 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms