Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrkczQ02956 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrkczQ02956 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PrkczQ02956 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrkczQ02956 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrkczQ02956 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrkczQ02956 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrkczQ02956 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrkczQ02956 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrkczQ02956 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms