Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP4A11Q02928 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP4A11Q02928 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CYP4A11Q02928 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP4A11Q02928 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP4A11Q02928 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP4A11Q02928 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP4A11Q02928 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP4A11Q02928 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP4A11Q02928 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP4A11Q02928 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CYP4A11Q02928 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYP4A11Q02928 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP4A11Q02928 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CYP4A11Q02928 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP4A11Q02928 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP4A11Q02928 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP4A11Q02928 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CYP4A11Q02928 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP4A11Q02928 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP4A11Q02928 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP4A11Q02928 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP4A11Q02928 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms