Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKCEQ02156 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCEQ02156 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCEQ02156 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms