Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDE1BQ01064 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDE1BQ01064 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE1BQ01064 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms