Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSF1Q00613 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSF1Q00613 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms