Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd80Q00609 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd80Q00609 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd80Q00609 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd80Q00609 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd80Q00609 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd80Q00609 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd80Q00609 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd80Q00609 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd80Q00609 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd80Q00609 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms