Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbbp6P97868 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbbp6P97868 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbbp6P97868 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbbp6P97868 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbbp6P97868 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbbp6P97868 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rbbp6P97868 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbbp6P97868 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbbp6P97868 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbbp6P97868 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbbp6P97868 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rbbp6P97868 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Rbbp6P97868 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rbbp6P97868 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rbbp6P97868 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms