Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
rp9P97762 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
rp9P97762 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
rp9P97762 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
rp9P97762 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
rp9P97762 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
rp9P97762 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
rp9P97762 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
rp9P97762 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
rp9P97762 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
rp9P97762 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
rp9P97762 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
rp9P97762 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
rp9P97762 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
rp9P97762 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
rp9P97762 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
rp9P97762 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
rp9P97762 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
rp9P97762 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
rp9P97762 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
rp9P97762 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
rp9P97762 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
rp9P97762 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
rp9P97762 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
rp9P97762 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
rp9P97762 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
rp9P97762 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
rp9P97762 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
rp9P97762 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
rp9P97762 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
rp9P97762 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
rp9P97762 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
rp9P97762 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
rp9P97762 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
rp9P97762 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
rp9P97762 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
rp9P97762 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
rp9P97762 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
rp9P97762 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
rp9P97762 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
rp9P97762 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
rp9P97762 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
rp9P97762 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
rp9P97762 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
rp9P97762 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
rp9P97762 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
rp9P97762 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
rp9P97762 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
rp9P97762 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
rp9P97762 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
rp9P97762 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
rp9P97762 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
rp9P97762 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
rp9P97762 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
rp9P97762 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
rp9P97762 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
rp9P97762 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
rp9P97762 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
rp9P97762 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
rp9P97762 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
rp9P97762 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
rp9P97762 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
rp9P97762 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
rp9P97762 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
rp9P97762 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
rp9P97762 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
rp9P97762 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
rp9P97762 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
rp9P97762 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
rp9P97762 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
rp9P97762 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
rp9P97762 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
rp9P97762 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
rp9P97762 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
rp9P97762 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
rp9P97762 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
rp9P97762 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
rp9P97762 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
rp9P97762 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
rp9P97762 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
rp9P97762 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
rp9P97762 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
rp9P97762 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
rp9P97762 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
rp9P97762 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
rp9P97762 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
rp9P97762 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
rp9P97762 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
rp9P97762 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
rp9P97762 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
rp9P97762 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
rp9P97762 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
rp9P97762 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
rp9P97762 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
rp9P97762 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
rp9P97762 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
rp9P97762 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
rp9P97762 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
rp9P97762 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
rp9P97762 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms