Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pitx2P97474 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pitx2P97474 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms