Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubg1P83887 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubg1P83887 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms