Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPS9P82933 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPS9P82933 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRPS9P82933 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRPS9P82933 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRPS9P82933 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms