Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irx1P81068 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irx1P81068 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irx1P81068 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx1P81068 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx1P81068 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx1P81068 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx1P81068 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx1P81068 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx1P81068 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx1P81068 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx1P81068 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx1P81068 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx1P81068 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx1P81068 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx1P81068 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irx1P81068 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx1P81068 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx1P81068 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx1P81068 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx1P81068 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx1P81068 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx1P81068 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx1P81068 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irx1P81068 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx1P81068 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx1P81068 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx1P81068 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx1P81068 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx1P81068 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irx1P81068 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.8 ms