Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptprn2P80560 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptprn2P80560 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.5 ms