Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHC1P78364 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHC1P78364 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHC1P78364 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHC1P78364 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHC1P78364 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHC1P78364 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHC1P78364 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PHC1P78364 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHC1P78364 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHC1P78364 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHC1P78364 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHC1P78364 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHC1P78364 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHC1P78364 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHC1P78364 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHC1P78364 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHC1P78364 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHC1P78364 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHC1P78364 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHC1P78364 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHC1P78364 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHC1P78364 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHC1P78364 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHC1P78364 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHC1P78364 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHC1P78364 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHC1P78364 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHC1P78364 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHC1P78364 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHC1P78364 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHC1P78364 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHC1P78364 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHC1P78364 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHC1P78364 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHC1P78364 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHC1P78364 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHC1P78364 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHC1P78364 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHC1P78364 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHC1P78364 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHC1P78364 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHC1P78364 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHC1P78364 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHC1P78364 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHC1P78364 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHC1P78364 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHC1P78364 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHC1P78364 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHC1P78364 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHC1P78364 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHC1P78364 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHC1P78364 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHC1P78364 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHC1P78364 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHC1P78364 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHC1P78364 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHC1P78364 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHC1P78364 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHC1P78364 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHC1P78364 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHC1P78364 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHC1P78364 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHC1P78364 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHC1P78364 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHC1P78364 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHC1P78364 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHC1P78364 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHC1P78364 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHC1P78364 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHC1P78364 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHC1P78364 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHC1P78364 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHC1P78364 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHC1P78364 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHC1P78364 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHC1P78364 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHC1P78364 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHC1P78364 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHC1P78364 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHC1P78364 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHC1P78364 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHC1P78364 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHC1P78364 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHC1P78364 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms