Protein–RNA interactions for Protein: P70407

Cdh9, Cadherin-9, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh9P70407 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh9P70407 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh9P70407 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdh9P70407 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms