Protein–RNA interactions for Protein: P70206

Plxna1, Plexin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna1P70206 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Plxna1P70206 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plxna1P70206 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plxna1P70206 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Plxna1P70206 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Plxna1P70206 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Plxna1P70206 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Plxna1P70206 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plxna1P70206 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plxna1P70206 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plxna1P70206 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plxna1P70206 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plxna1P70206 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plxna1P70206 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plxna1P70206 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plxna1P70206 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Plxna1P70206 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms