Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acta1P68134 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acta1P68134 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Acta1P68134 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acta1P68134 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Acta1P68134 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Acta1P68134 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Acta1P68134 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Acta1P68134 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Acta1P68134 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Acta1P68134 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Acta1P68134 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Acta1P68134 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms