Protein–RNA interactions for Protein: P62754

Rps6, 40S ribosomal protein S6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6P62754 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rps6P62754 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6P62754 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6P62754 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6P62754 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6P62754 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6P62754 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rps6P62754 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6P62754 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6P62754 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6P62754 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6P62754 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6P62754 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6P62754 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6P62754 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6P62754 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6P62754 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6P62754 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6P62754 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6P62754 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6P62754 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6P62754 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6P62754 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms