Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps18P62270 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps18P62270 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps18P62270 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps18P62270 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps18P62270 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps18P62270 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps18P62270 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps18P62270 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps18P62270 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps18P62270 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps18P62270 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps18P62270 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps18P62270 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps18P62270 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps18P62270 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps18P62270 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps18P62270 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps18P62270 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps18P62270 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps18P62270 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps18P62270 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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