Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tdrd6P61407 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tdrd6P61407 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tdrd6P61407 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tdrd6P61407 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tdrd6P61407 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tdrd6P61407 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tdrd6P61407 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tdrd6P61407 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdrd6P61407 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdrd6P61407 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms