Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCE1P61221 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCE1P61221 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCE1P61221 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms