Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Nphp4P59240 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nphp4P59240 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Nphp4P59240 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Nphp4P59240 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms