Protein–RNA interactions for Protein: P58417

NXPH1, Neurexophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPH1P58417 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NXPH1P58417 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NXPH1P58417 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NXPH1P58417 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPH1P58417 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPH1P58417 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NXPH1P58417 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPH1P58417 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPH1P58417 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPH1P58417 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPH1P58417 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPH1P58417 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXPH1P58417 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPH1P58417 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXPH1P58417 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms