Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp25P57080 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp25P57080 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp25P57080 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp25P57080 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp25P57080 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp25P57080 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp25P57080 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp25P57080 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp25P57080 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp25P57080 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp25P57080 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp25P57080 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp25P57080 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp25P57080 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp25P57080 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp25P57080 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp25P57080 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms