Protein–RNA interactions for Protein: P56960

Exosc10, Exosome component 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc10P56960 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Exosc10P56960 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Exosc10P56960 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Exosc10P56960 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc10P56960 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms