Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Bace1P56818 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Bace1P56818 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bace1P56818 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bace1P56818 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bace1P56818 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bace1P56818 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bace1P56818 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bace1P56818 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bace1P56818 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bace1P56818 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bace1P56818 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bace1P56818 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bace1P56818 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bace1P56818 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bace1P56818 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms