Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTBP2P56545 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTBP2P56545 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTBP2P56545 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms