Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CartptP56388 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CartptP56388 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CartptP56388 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CartptP56388 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CartptP56388 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CartptP56388 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CartptP56388 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CartptP56388 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CartptP56388 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CartptP56388 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CartptP56388 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CartptP56388 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CartptP56388 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CartptP56388 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CartptP56388 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CartptP56388 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CartptP56388 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CartptP56388 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CartptP56388 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CartptP56388 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CartptP56388 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CartptP56388 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CartptP56388 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CartptP56388 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CartptP56388 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CartptP56388 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CartptP56388 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
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CartptP56388 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CartptP56388 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CartptP56388 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CartptP56388 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CartptP56388 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CartptP56388 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CartptP56388 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CartptP56388 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CartptP56388 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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CartptP56388 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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CartptP56388 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CartptP56388 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CartptP56388 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CartptP56388 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CartptP56388 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CartptP56388 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CartptP56388 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CartptP56388 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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CartptP56388 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CartptP56388 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CartptP56388 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CartptP56388 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CartptP56388 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CartptP56388 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CartptP56388 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CartptP56388 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CartptP56388 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CartptP56388 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CartptP56388 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms