Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp1P55194 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp1P55194 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1P55194 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms