Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN5P54829 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN5P54829 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPN5P54829 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN5P54829 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms