Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rad23bP54728 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rad23bP54728 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rad23bP54728 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms