Protein–RNA interactions for Protein: P54227

Stmn1, Stathmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn1P54227 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stmn1P54227 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stmn1P54227 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stmn1P54227 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms