Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cux1P53564 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Cux1P53564 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Cux1P53564 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Cux1P53564 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cux1P53564 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cux1P53564 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cux1P53564 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cux1P53564 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cux1P53564 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cux1P53564 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cux1P53564 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Cux1P53564 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cux1P53564 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cux1P53564 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cux1P53564 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cux1P53564 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cux1P53564 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cux1P53564 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Cux1P53564 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cux1P53564 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cux1P53564 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cux1P53564 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cux1P53564 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cux1P53564 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cux1P53564 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cux1P53564 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cux1P53564 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms