Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFF1P51825 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFF1P51825 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFF1P51825 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AFF1P51825 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFF1P51825 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFF1P51825 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFF1P51825 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFF1P51825 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFF1P51825 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AFF1P51825 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AFF1P51825 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AFF1P51825 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AFF1P51825 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
AFF1P51825 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF1P51825 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF1P51825 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF1P51825 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF1P51825 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF1P51825 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF1P51825 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF1P51825 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFF1P51825 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFF1P51825 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFF1P51825 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFF1P51825 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFF1P51825 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFF1P51825 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFF1P51825 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFF1P51825 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFF1P51825 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFF1P51825 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFF1P51825 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFF1P51825 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFF1P51825 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
AFF1P51825 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFF1P51825 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFF1P51825 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFF1P51825 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFF1P51825 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFF1P51825 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFF1P51825 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFF1P51825 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
AFF1P51825 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFF1P51825 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFF1P51825 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFF1P51825 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFF1P51825 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFF1P51825 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFF1P51825 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFF1P51825 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFF1P51825 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFF1P51825 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFF1P51825 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFF1P51825 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFF1P51825 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFF1P51825 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFF1P51825 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFF1P51825 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFF1P51825 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AFF1P51825 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFF1P51825 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFF1P51825 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFF1P51825 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFF1P51825 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AFF1P51825 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFF1P51825 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFF1P51825 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AFF1P51825 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
AFF1P51825 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFF1P51825 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AFF1P51825 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
AFF1P51825 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
AFF1P51825 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFF1P51825 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFF1P51825 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFF1P51825 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFF1P51825 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFF1P51825 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
AFF1P51825 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AFF1P51825 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFF1P51825 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
AFF1P51825 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFF1P51825 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFF1P51825 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFF1P51825 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFF1P51825 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AFF1P51825 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFF1P51825 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AFF1P51825 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
AFF1P51825 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFF1P51825 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFF1P51825 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFF1P51825 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFF1P51825 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFF1P51825 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AFF1P51825 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFF1P51825 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFF1P51825 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AFF1P51825 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms