Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERFP50548 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERFP50548 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERFP50548 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERFP50548 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERFP50548 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERFP50548 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERFP50548 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERFP50548 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERFP50548 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERFP50548 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERFP50548 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERFP50548 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERFP50548 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERFP50548 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERFP50548 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERFP50548 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERFP50548 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERFP50548 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERFP50548 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERFP50548 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERFP50548 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERFP50548 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERFP50548 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERFP50548 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERFP50548 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERFP50548 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERFP50548 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERFP50548 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERFP50548 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERFP50548 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERFP50548 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERFP50548 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERFP50548 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERFP50548 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERFP50548 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERFP50548 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERFP50548 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERFP50548 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERFP50548 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERFP50548 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERFP50548 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERFP50548 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERFP50548 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERFP50548 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERFP50548 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERFP50548 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERFP50548 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERFP50548 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERFP50548 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERFP50548 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERFP50548 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERFP50548 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERFP50548 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERFP50548 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERFP50548 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERFP50548 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERFP50548 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERFP50548 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERFP50548 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERFP50548 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERFP50548 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERFP50548 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERFP50548 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERFP50548 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERFP50548 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERFP50548 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERFP50548 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERFP50548 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERFP50548 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERFP50548 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERFP50548 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERFP50548 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERFP50548 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERFP50548 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERFP50548 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERFP50548 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERFP50548 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERFP50548 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERFP50548 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERFP50548 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERFP50548 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERFP50548 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERFP50548 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERFP50548 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERFP50548 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERFP50548 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERFP50548 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERFP50548 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERFP50548 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERFP50548 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ERFP50548 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERFP50548 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERFP50548 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERFP50548 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERFP50548 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERFP50548 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERFP50548 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERFP50548 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERFP50548 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms