Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gdi1P50396 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdi1P50396 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gdi1P50396 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gdi1P50396 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gdi1P50396 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdi1P50396 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdi1P50396 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdi1P50396 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gdi1P50396 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms